いくつかのリスク分担方法が一般的です：

    グループ・モデルおよびIPAモデルではしばしば、、HMOが一定の割合でリスクを負担し、残りのリスクを契約医師が負担します。同様に、コスト節約額 に対しては、既定の割合がまずHMOに蓄積され、その後残りが医師に分配されます。コストおよび節約額の割り当て基準として、割合よりも実際の金額を使うバリエーションも存在します。
    リスクの共同管理は、IPAモデルで最もよく使われます。この取り決めでは、医師の報酬額またはキャピテーション額の一定割合がHMOによって将来の過剰コストを補う責務として保留されます。　 実際のコストが明らかになる年度末に、過剰コストは交渉済みの公式に従って、リスク共同管理金で相殺されます。反対に、コストが予測を下回った場合には、 節約額は参加している医師に分配されるか、あるいは将来的に予測される経費のためにリスク共同管理金に加算されます。
    スタッフ・モデルでは賞与がもっともよく使われます。この方式では、実際のコストが予測より低かった場合には、医師は現金賞与を受け取ります。

支払いおよびリスクの共同分担に加えて、その他の契約の医療機関規定には医療過誤保険を必要なものとして含んでいます。契約には、医療過誤保険の購入と支払に対し誰に責任があり、どのような補償が必要かを記載しなければなりません。

殆どの医師や医療グループが、事前に設定された制限額あるいは「トリガー・ポイント」を超えたコストを保障する、超過損害保険を購入します。この保険は、 リスク管理金を放棄したり財政的に不安定になる事態から医師または医療グループ/IPAを保護します。制限額は、各事例ごとおよび/あるいはプラン全体に対する総合的レベルで設定することができ、契約に記載されます。

HMOに関与する全ての医師は、品質保証プログラムに参加することに同意しなくてはなりません。これは、専門医への紹介のみでなく、入院および外来治療の適正利用を管理しモニターする作業を伴います。医師は、救急でない特定の医療サービスに対する事前承認の必要性など、一定の規則および手続きに従う事に同意しなければなりません。また、州規制や連邦規制をすべて遵守することにも同意しなければなりません。

品質管理（QA）プログラムは、HMO医師、看護師、医療助手で構成され、医療記録のチェックを通してメンバーに提供された医療サービスの質をモニターします。品質管理部はまた、医療の質、アクセス、治療の遅延、専門医への紹介の遅延、繰り延べ治療に関するメンバーの苦情の調査、解決にも関わります。

キャピテーション方式で支払いを受け取る医師は、請求処理を行う必要がありません。しかしながら、HMOが「発生データ」として処理する利用状況データを提出する必要があります。

一方、キャピテーション方式を取り入れていない医療機関は、支払いの処理請求を行わなければならず、これらの殆どが事前承認を必要とします。請求処理は、 請求金額で記録され、日割り報酬あるいは割引された出来高払い報酬などの、契約で定められた金額で支払いがなされます。

支払請求には、後の利用状況レポートの為に記録され使用される重要な情報も含まれています。この情報には通常、入院日数、DRGやCPTなどの診断コード や処置コード、治療日、医療機関の番号および名前、入院・外来・救急などの請求の種類が含まれます。

請求処理部は給付調整（COB）を行います。その為には、メンバーが他の利用できる補償給付プランをもっているか、また、治療の支払い義務が他の保険会社あるいはHMOにもあるかどうかを決定する必要があります。

調整は、第三者賠償責任（TPL）請求に対しても必要です。これはメンバーが職場で怪我をし、労働災害補償が医療費支払いの第一責任者である場合に起こり ます。また、メンバーが事故で怪我をし、自動車保険など他のタイプの保険に医療費支払いの責任がある場合にも起こります。

HMOでは通常、治療が施された日と、医療機関からの支払請求を受け取る時との間に時間のずれがあります。しかしながら、債務は治療の時点で存在してお り、HMOはこれらの請求に対して財務処理上債務を立証しなければなりません。この債務を一般に、「既発生未報告」（IBNR）と呼びます。

メンバーサービス

メンバーサービスはHMOとメンバーの間の連絡係りとして、既存および潜在的メンバーからの、給付、加入資格、HMO手続きに関連する質問に答えます。 既存のHMO加入者に対しては、メンバーサービス担当者が質問や苦情に対応し、請求処理の進行状況を追跡し、メンバーのリクエストに応えネットワーク内 の他の医療機関への移動を処理します。